После подтверждения рака лёгкого перед врачом возникает следующий вопрос: какое лечение подойдёт конкретному пациенту? Опухоли с одинаковым гистологическим диагнозом могут различаться по молекулярным характеристикам. Часть этих различий влияет на выбор лекарственной терапии — поэтому исследование опухолевых маркеров становится одним из этапов обследования.

Рассмотрим, какие задачи решает молекулярная диагностика при немелкоклеточном раке лёгкого и какие исследования можно выполнять с помощью наборов ТестГен.

Какие изменения ищут в опухоли

При немелкоклеточном раке лёгкого (НМРЛ) исследуют генетические изменения, которые могут определять чувствительность опухоли к определённым препаратам. Среди таких мишеней — мутации в генах EGFR, BRAF и KRAS, перестройки генов ALK, ROS1 и другие изменения.

Объём обследования зависит от гистологического типа опухоли, стадии заболевания и клинической ситуации. Например, при распространённом неплоскоклеточном НМРЛ молекулярное исследование помогает установить, есть ли основания для назначения таргетной терапии. В отдельных ситуациях результаты необходимы и при выборе лечения после операции. Подходы к обследованию представлены в рекомендациях RUSSCO по немелкоклеточному раку лёгкого.

Для лаборатории здесь важен конкретный перечень определяемых изменений. Формулировки «исследование гена» недостаточно: разные тест-системы могут выявлять разные варианты в одном и том же гене.

Исследование EGFR: значение имеет состав панели

Для определения мутаций EGFR в фиксированной опухолевой ткани мы разработали набор ТЕСТ-EGFR-ТКАНЬ-МУЛЬТИ. Он предназначен для исследования ДНК из ткани, фиксированной в формалине и заключённой в парафин, — FFPE-материала.

Набор позволяет определять 48 мутаций гена EGFR. При этом некоторые варианты выявляются без разграничения внутри группы. Эту особенность необходимо учитывать при подготовке лабораторного заключения: обнаружение изменения и установление его точного варианта — разные уровни детализации результата.

Для работы с плазмой крови предназначен отдельный набор — ТЕСТ-EGFR-ПЛАЗМА. Он выявляет 29 мутаций: p.Leu858Arg, p.Thr790Met и 27 делеций в 19-м экзоне EGFR. Такой формат исследования может использоваться, когда адекватный опухолевый материал недоступен, а также при обследовании пациентов в ходе лечения в пределах назначения набора.

Тканевой и плазменный тесты различаются материалом и перечнем определяемых вариантов. Выбор между ними как правило производится на основании стадии заболевания.

BRAF и KRAS: поиск конкретных вариантов

Набор ТЕСТ-BRAF-KRAS-ТКАНЬ предназначен для качественного определения мутаций в ДНК, выделенной из ткани. Он выявляет варианты V600E и V600E complex в гене BRAF, не различая их между собой, а также вариант p.Gly12Cys в гене KRAS.

Такой состав позволяет решать определённую диагностическую задачу. Отрицательный результат означает, что предусмотренные набором изменения не обнаружены в исследованном образце. Он не исключает другие мутации BRAF или KRAS и изменения в других генах.

Поэтому отдельный ПЦР-тест включают в общий план обследования пациента. Достаточность выполненных исследований оценивают с учётом клинической задачи и уже полученных результатов.

Что важно при выборе материала

Для исследования нужен образец, пригодный для выбранной методики. При работе с опухолевой тканью имеют значение наличие опухолевых клеток и сохранность материала. Если образца недостаточно для анализа, лаборатория может не получить информацию, необходимую врачу.

Жидкая биопсия позволяет исследовать опухолевую ДНК, поступающую в кровоток. Однако отрицательный результат анализа плазмы не всегда исключает мутацию в опухоли: её ДНК может присутствовать в образце в количестве, недостаточном для обнаружения. В такой ситуации врач может рассмотреть исследование опухолевой ткани, если её получение возможно. Эта особенность описана в материале MedlinePlus о генетических исследованиях при раке лёгкого.

Как результат помогает врачу

Выявленное изменение может стать основанием для рассмотрения соответствующей таргетной терапии. Окончательное решение принимает онколог с учётом стадии заболевания, состояния пациента, предшествующего лечения и доступных лечебных возможностей. Само наличие молекулярной мишени не гарантирует ответ на препарат.

При прогрессировании заболевания может потребоваться повторное исследование: молекулярные характеристики опухоли способны меняться в ходе лечения. Подробнее о связи биомаркеров с выбором терапии рассказывает Национальный институт рака США.

Молекулярные тесты, о которых идёт речь, применяют для уточнения характеристик уже выявленной опухоли. Они не предназначены для профилактического обследования здоровых людей или самостоятельного установления диагноза рака лёгкого.