Как проверить один образец сразу на несколько респираторных вирусов и сохранить чувствительность каждой реакции? С этой задачи началась разработка ARVI-TEST-MAX. О том, как команда подбирала мишени, объединяла их в панели и проверяла работу набора, рассказал Антон Геннадьевич Семанин, научный сотрудник компании «ТестГен».
При выборе учитывали частоту встречаемости возбудителей и их значение для лабораторной диагностики. Для каждого вируса нужно было найти участок генома, который сохраняется у разных вариантов этого вируса и при этом позволяет отличить его от других возбудителей. По этим участкам подбирали праймеры и зонды, которые распознают мишени во время анализа.
В одном протоколе нужно было совместить выявление РНК- и ДНК-вирусов. Для работы с РНК в протокол включили этап обратной транскрипции. При этом важно было сохранить чувствительность анализа для обоих типов мишеней.
В каждой пробирке работают сразу несколько пар праймеров и зондов. Их неспецифическое взаимодействие может привести к ложному сигналу или снижению чувствительности. Поэтому команда подбирала сочетания мишеней для каждой реакции и распределяла сигналы по каналам детекции.
Команда использовала зарегистрированные контрольные материалы с респираторными возбудителями. При оценке аналитической специфичности проверяли, возникает ли сигнал в присутствии нецелевого материала, в том числе геномной ДНК человека. На стандартных образцах оценивали повторяемость и воспроизводимость результатов.
При разработке предусмотрели ручное и автоматическое выделение нуклеиновых кислот. Набор адаптировали для шести моделей амплификаторов. Перед внедрением разработчик рекомендует сверить модель прибора с инструкцией и, если лаборатория использует автоматическое выделение, уточнить совместимость системы пробоподготовки.
Состав панели, список совместимых амплификаторов и инструкция к ARVI-TEST-MAX
Свяжитесь с отделом продаж «ТестГен». Укажите модель амплификатора и способ выделения нуклеиновых кислот. Наши специалисты помогут уточнить совместимость оборудования и ответят на вопросы о подготовке образцов и постановке анализа.
Отдел продаж
8 800 350-13-01 ·
sale@testgen.ru